Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC12A4Q9UP95 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms