Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXO40Q9UH90 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO40Q9UH90 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms