Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B2

PTGFRN, Prostaglandin F2 receptor negative regulator, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRNQ9P2B2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTGFRNQ9P2B2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTGFRNQ9P2B2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTGFRNQ9P2B2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTGFRNQ9P2B2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTGFRNQ9P2B2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTGFRNQ9P2B2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTGFRNQ9P2B2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTGFRNQ9P2B2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTGFRNQ9P2B2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTGFRNQ9P2B2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTGFRNQ9P2B2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTGFRNQ9P2B2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTGFRNQ9P2B2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTGFRNQ9P2B2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTGFRNQ9P2B2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTGFRNQ9P2B2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTGFRNQ9P2B2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTGFRNQ9P2B2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTGFRNQ9P2B2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTGFRNQ9P2B2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTGFRNQ9P2B2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTGFRNQ9P2B2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTGFRNQ9P2B2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTGFRNQ9P2B2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTGFRNQ9P2B2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTGFRNQ9P2B2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PTGFRNQ9P2B2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PTGFRNQ9P2B2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PTGFRNQ9P2B2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTGFRNQ9P2B2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTGFRNQ9P2B2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTGFRNQ9P2B2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTGFRNQ9P2B2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTGFRNQ9P2B2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTGFRNQ9P2B2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTGFRNQ9P2B2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTGFRNQ9P2B2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms