Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDK12Q9NYV4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDK12Q9NYV4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms