Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
A4GALTQ9NPC4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
A4GALTQ9NPC4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms