Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD15

SRA1, Steroid receptor RNA activator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRA1Q9HD15 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRA1Q9HD15 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRA1Q9HD15 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRA1Q9HD15 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms