Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CENPJQ9HC77 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CENPJQ9HC77 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CENPJQ9HC77 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CENPJQ9HC77 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CENPJQ9HC77 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CENPJQ9HC77 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CENPJQ9HC77 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CENPJQ9HC77 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CENPJQ9HC77 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CENPJQ9HC77 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CENPJQ9HC77 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CENPJQ9HC77 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CENPJQ9HC77 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CENPJQ9HC77 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CENPJQ9HC77 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CENPJQ9HC77 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CENPJQ9HC77 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC28.83■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms