Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS26

ERP44, Endoplasmic reticulum resident protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERP44Q9BS26 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ERP44Q9BS26 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ERP44Q9BS26 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ERP44Q9BS26 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ERP44Q9BS26 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ERP44Q9BS26 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERP44Q9BS26 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERP44Q9BS26 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERP44Q9BS26 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERP44Q9BS26 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERP44Q9BS26 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERP44Q9BS26 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERP44Q9BS26 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERP44Q9BS26 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERP44Q9BS26 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERP44Q9BS26 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERP44Q9BS26 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERP44Q9BS26 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERP44Q9BS26 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERP44Q9BS26 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERP44Q9BS26 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERP44Q9BS26 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERP44Q9BS26 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERP44Q9BS26 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERP44Q9BS26 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERP44Q9BS26 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERP44Q9BS26 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERP44Q9BS26 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms