Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCZQ96LD1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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