Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RTP4Q96DX8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RTP4Q96DX8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RTP4Q96DX8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RTP4Q96DX8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RTP4Q96DX8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RTP4Q96DX8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTP4Q96DX8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTP4Q96DX8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTP4Q96DX8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTP4Q96DX8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTP4Q96DX8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTP4Q96DX8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTP4Q96DX8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTP4Q96DX8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTP4Q96DX8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms