Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ0

HAVCR2, Hepatitis A virus cellular receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAVCR2Q8TDQ0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HAVCR2Q8TDQ0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms