Protein–RNA interactions for Protein: Q8N268

C20orf197, Uncharacterized protein C20orf197, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf197Q8N268 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
C20orf197Q8N268 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms