Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI1

RHOT2, Mitochondrial Rho GTPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT2Q8IXI1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RHOT2Q8IXI1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHOT2Q8IXI1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHOT2Q8IXI1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHOT2Q8IXI1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHOT2Q8IXI1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHOT2Q8IXI1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHOT2Q8IXI1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHOT2Q8IXI1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOT2Q8IXI1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOT2Q8IXI1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOT2Q8IXI1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOT2Q8IXI1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOT2Q8IXI1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOT2Q8IXI1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOT2Q8IXI1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOT2Q8IXI1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOT2Q8IXI1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOT2Q8IXI1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOT2Q8IXI1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOT2Q8IXI1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOT2Q8IXI1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOT2Q8IXI1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOT2Q8IXI1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOT2Q8IXI1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOT2Q8IXI1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOT2Q8IXI1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RHOT2Q8IXI1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOT2Q8IXI1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOT2Q8IXI1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOT2Q8IXI1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOT2Q8IXI1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOT2Q8IXI1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RHOT2Q8IXI1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHOT2Q8IXI1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms