Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTN6

STRADA, STE20-related kinase adapter protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADAQ7RTN6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
STRADAQ7RTN6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
STRADAQ7RTN6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
STRADAQ7RTN6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
STRADAQ7RTN6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
STRADAQ7RTN6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
STRADAQ7RTN6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
STRADAQ7RTN6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
STRADAQ7RTN6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
STRADAQ7RTN6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
STRADAQ7RTN6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
STRADAQ7RTN6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
STRADAQ7RTN6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
STRADAQ7RTN6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
STRADAQ7RTN6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
STRADAQ7RTN6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
STRADAQ7RTN6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
STRADAQ7RTN6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
STRADAQ7RTN6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
STRADAQ7RTN6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
STRADAQ7RTN6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
STRADAQ7RTN6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
STRADAQ7RTN6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
STRADAQ7RTN6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
STRADAQ7RTN6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
STRADAQ7RTN6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
STRADAQ7RTN6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
STRADAQ7RTN6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
STRADAQ7RTN6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
STRADAQ7RTN6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
STRADAQ7RTN6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
STRADAQ7RTN6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
STRADAQ7RTN6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
STRADAQ7RTN6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
STRADAQ7RTN6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
STRADAQ7RTN6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRADAQ7RTN6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRADAQ7RTN6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRADAQ7RTN6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRADAQ7RTN6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRADAQ7RTN6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRADAQ7RTN6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRADAQ7RTN6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRADAQ7RTN6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRADAQ7RTN6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRADAQ7RTN6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRADAQ7RTN6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRADAQ7RTN6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRADAQ7RTN6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
STRADAQ7RTN6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRADAQ7RTN6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRADAQ7RTN6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRADAQ7RTN6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRADAQ7RTN6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRADAQ7RTN6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRADAQ7RTN6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRADAQ7RTN6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRADAQ7RTN6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRADAQ7RTN6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRADAQ7RTN6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRADAQ7RTN6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRADAQ7RTN6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRADAQ7RTN6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRADAQ7RTN6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRADAQ7RTN6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRADAQ7RTN6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRADAQ7RTN6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
STRADAQ7RTN6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
STRADAQ7RTN6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRADAQ7RTN6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRADAQ7RTN6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRADAQ7RTN6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRADAQ7RTN6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRADAQ7RTN6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRADAQ7RTN6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRADAQ7RTN6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRADAQ7RTN6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
STRADAQ7RTN6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRADAQ7RTN6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRADAQ7RTN6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRADAQ7RTN6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRADAQ7RTN6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
STRADAQ7RTN6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRADAQ7RTN6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRADAQ7RTN6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRADAQ7RTN6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRADAQ7RTN6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRADAQ7RTN6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRADAQ7RTN6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRADAQ7RTN6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRADAQ7RTN6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRADAQ7RTN6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRADAQ7RTN6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRADAQ7RTN6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRADAQ7RTN6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRADAQ7RTN6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRADAQ7RTN6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRADAQ7RTN6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRADAQ7RTN6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRADAQ7RTN6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms