Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC73Q6ZRK6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC73Q6ZRK6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms