Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYC1

CLVS2, Clavesin-2, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS2Q5SYC1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CLVS2Q5SYC1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLVS2Q5SYC1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLVS2Q5SYC1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLVS2Q5SYC1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLVS2Q5SYC1 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLVS2Q5SYC1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLVS2Q5SYC1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLVS2Q5SYC1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLVS2Q5SYC1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLVS2Q5SYC1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLVS2Q5SYC1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLVS2Q5SYC1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLVS2Q5SYC1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLVS2Q5SYC1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLVS2Q5SYC1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLVS2Q5SYC1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms