Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VWC2Q2TAL6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms