Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKIDA1Q1XH10 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKIDA1Q1XH10 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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