Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRRQ15256 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRRQ15256 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms