Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PDCD1Q15116 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDCD1Q15116 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
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