Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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TOP3AQ13472 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
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TOP3AQ13472 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TOP3AQ13472 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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