Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MC1RQ01726 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MC1RQ01726 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms