Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPM4P67936 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPM4P67936 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPM4P67936 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPM4P67936 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPM4P67936 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPM4P67936 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPM4P67936 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPM4P67936 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPM4P67936 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPM4P67936 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPM4P67936 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPM4P67936 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPM4P67936 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPM4P67936 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPM4P67936 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPM4P67936 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPM4P67936 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPM4P67936 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TPM4P67936 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPM4P67936 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPM4P67936 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPM4P67936 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPM4P67936 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPM4P67936 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPM4P67936 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPM4P67936 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPM4P67936 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPM4P67936 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPM4P67936 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPM4P67936 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPM4P67936 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPM4P67936 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPM4P67936 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPM4P67936 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPM4P67936 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TPM4P67936 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TPM4P67936 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TPM4P67936 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TPM4P67936 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
TPM4P67936 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPM4P67936 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPM4P67936 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPM4P67936 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPM4P67936 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPM4P67936 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPM4P67936 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPM4P67936 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPM4P67936 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPM4P67936 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPM4P67936 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPM4P67936 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPM4P67936 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPM4P67936 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPM4P67936 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPM4P67936 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPM4P67936 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPM4P67936 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPM4P67936 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPM4P67936 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPM4P67936 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPM4P67936 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TPM4P67936 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPM4P67936 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPM4P67936 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPM4P67936 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPM4P67936 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPM4P67936 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPM4P67936 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPM4P67936 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPM4P67936 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPM4P67936 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPM4P67936 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TPM4P67936 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPM4P67936 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPM4P67936 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPM4P67936 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPM4P67936 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPM4P67936 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPM4P67936 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPM4P67936 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPM4P67936 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPM4P67936 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPM4P67936 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPM4P67936 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPM4P67936 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPM4P67936 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPM4P67936 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPM4P67936 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPM4P67936 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPM4P67936 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPM4P67936 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPM4P67936 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPM4P67936 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TPM4P67936 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPM4P67936 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPM4P67936 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPM4P67936 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPM4P67936 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPM4P67936 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms