Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SUMO1P63165 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SUMO1P63165 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms