Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NME5P56597 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NME5P56597 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NME5P56597 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NME5P56597 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NME5P56597 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NME5P56597 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NME5P56597 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NME5P56597 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NME5P56597 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NME5P56597 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NME5P56597 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NME5P56597 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NME5P56597 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NME5P56597 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NME5P56597 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NME5P56597 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NME5P56597 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NME5P56597 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NME5P56597 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NME5P56597 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NME5P56597 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NME5P56597 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NME5P56597 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NME5P56597 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NME5P56597 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NME5P56597 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NME5P56597 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NME5P56597 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NME5P56597 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NME5P56597 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NME5P56597 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NME5P56597 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NME5P56597 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NME5P56597 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NME5P56597 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NME5P56597 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NME5P56597 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NME5P56597 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NME5P56597 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NME5P56597 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NME5P56597 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NME5P56597 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NME5P56597 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NME5P56597 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NME5P56597 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NME5P56597 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NME5P56597 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NME5P56597 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NME5P56597 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NME5P56597 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NME5P56597 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NME5P56597 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NME5P56597 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NME5P56597 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NME5P56597 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NME5P56597 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NME5P56597 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NME5P56597 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NME5P56597 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NME5P56597 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NME5P56597 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NME5P56597 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NME5P56597 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NME5P56597 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NME5P56597 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NME5P56597 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NME5P56597 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NME5P56597 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NME5P56597 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NME5P56597 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NME5P56597 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NME5P56597 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NME5P56597 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NME5P56597 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NME5P56597 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NME5P56597 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NME5P56597 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NME5P56597 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NME5P56597 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NME5P56597 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NME5P56597 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NME5P56597 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NME5P56597 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NME5P56597 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NME5P56597 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NME5P56597 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NME5P56597 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NME5P56597 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NME5P56597 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NME5P56597 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NME5P56597 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NME5P56597 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NME5P56597 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NME5P56597 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NME5P56597 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NME5P56597 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NME5P56597 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NME5P56597 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NME5P56597 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms