Protein–RNA interactions for Protein: P54821

PRRX1, Paired mesoderm homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1P54821 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRRX1P54821 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PRRX1P54821 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PRRX1P54821 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PRRX1P54821 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PRRX1P54821 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRRX1P54821 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRRX1P54821 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRRX1P54821 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRRX1P54821 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRRX1P54821 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRRX1P54821 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PRRX1P54821 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRRX1P54821 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRRX1P54821 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRRX1P54821 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRRX1P54821 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRRX1P54821 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRRX1P54821 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRRX1P54821 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRRX1P54821 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRRX1P54821 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRRX1P54821 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRRX1P54821 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRRX1P54821 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRRX1P54821 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRRX1P54821 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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