Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR2IP36954 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POLR2IP36954 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms