Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXA10P31260 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms