Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HLA-DMAP28067 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms