Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA2P26232 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA2P26232 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA2P26232 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA2P26232 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA2P26232 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA2P26232 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA2P26232 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA2P26232 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA2P26232 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA2P26232 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA2P26232 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA2P26232 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA2P26232 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA2P26232 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA2P26232 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA2P26232 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTNNA2P26232 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNA2P26232 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNA2P26232 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNA2P26232 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNA2P26232 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNA2P26232 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNA2P26232 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNA2P26232 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNA2P26232 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNA2P26232 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNA2P26232 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNA2P26232 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTNNA2P26232 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms