Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PTPRBP23467 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRBP23467 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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