Protein–RNA interactions for Protein: P18074

ERCC2, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPD subunit, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC2P18074 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERCC2P18074 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERCC2P18074 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ERCC2P18074 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERCC2P18074 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ERCC2P18074 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ERCC2P18074 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ERCC2P18074 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ERCC2P18074 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERCC2P18074 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERCC2P18074 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERCC2P18074 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ERCC2P18074 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERCC2P18074 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ERCC2P18074 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ERCC2P18074 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERCC2P18074 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERCC2P18074 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERCC2P18074 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ERCC2P18074 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERCC2P18074 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ERCC2P18074 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ERCC2P18074 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERCC2P18074 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERCC2P18074 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERCC2P18074 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERCC2P18074 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERCC2P18074 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERCC2P18074 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERCC2P18074 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ERCC2P18074 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ERCC2P18074 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ERCC2P18074 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ERCC2P18074 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ERCC2P18074 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERCC2P18074 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERCC2P18074 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ERCC2P18074 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERCC2P18074 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERCC2P18074 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERCC2P18074 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ERCC2P18074 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERCC2P18074 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERCC2P18074 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERCC2P18074 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERCC2P18074 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERCC2P18074 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ERCC2P18074 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERCC2P18074 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERCC2P18074 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERCC2P18074 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ERCC2P18074 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERCC2P18074 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ERCC2P18074 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC2P18074 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC2P18074 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC2P18074 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC2P18074 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC2P18074 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC2P18074 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC2P18074 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC2P18074 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC2P18074 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC2P18074 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC2P18074 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERCC2P18074 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC2P18074 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC2P18074 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC2P18074 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC2P18074 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC2P18074 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC2P18074 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC2P18074 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC2P18074 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC2P18074 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC2P18074 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC2P18074 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC2P18074 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC2P18074 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC2P18074 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC2P18074 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC2P18074 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERCC2P18074 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC2P18074 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC2P18074 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC2P18074 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC2P18074 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC2P18074 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC2P18074 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC2P18074 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC2P18074 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC2P18074 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC2P18074 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC2P18074 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC2P18074 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC2P18074 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC2P18074 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC2P18074 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERCC2P18074 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERCC2P18074 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms