Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms