Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
IFNB1P01574 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IFNB1P01574 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IFNB1P01574 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IFNB1P01574 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.32■■□□□ 1
IFNB1P01574 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFNB1P01574 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFNB1P01574 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFNB1P01574 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
IFNB1P01574 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFNB1P01574 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IFNB1P01574 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFNB1P01574 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFNB1P01574 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFNB1P01574 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.32■■□□□ 1
IFNB1P01574 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFNB1P01574 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IFNB1P01574 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IFNB1P01574 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IFNB1P01574 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
IFNB1P01574 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFNB1P01574 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFNB1P01574 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IFNB1P01574 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IFNB1P01574 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFNB1P01574 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IFNB1P01574 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFNB1P01574 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFNB1P01574 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFNB1P01574 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms