Protein–RNA interactions for Protein: P00966

ASS1, Argininosuccinate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASS1P00966 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASS1P00966 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASS1P00966 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASS1P00966 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASS1P00966 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASS1P00966 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASS1P00966 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASS1P00966 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASS1P00966 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASS1P00966 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASS1P00966 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASS1P00966 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ASS1P00966 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASS1P00966 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ASS1P00966 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASS1P00966 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASS1P00966 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASS1P00966 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASS1P00966 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASS1P00966 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASS1P00966 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASS1P00966 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASS1P00966 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASS1P00966 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASS1P00966 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASS1P00966 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASS1P00966 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASS1P00966 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASS1P00966 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASS1P00966 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASS1P00966 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASS1P00966 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASS1P00966 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASS1P00966 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ASS1P00966 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASS1P00966 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ASS1P00966 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASS1P00966 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASS1P00966 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASS1P00966 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASS1P00966 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASS1P00966 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASS1P00966 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ASS1P00966 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASS1P00966 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASS1P00966 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASS1P00966 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASS1P00966 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASS1P00966 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASS1P00966 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASS1P00966 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASS1P00966 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ASS1P00966 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASS1P00966 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASS1P00966 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASS1P00966 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASS1P00966 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ASS1P00966 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASS1P00966 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASS1P00966 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASS1P00966 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASS1P00966 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASS1P00966 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASS1P00966 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASS1P00966 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASS1P00966 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASS1P00966 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASS1P00966 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ASS1P00966 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASS1P00966 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASS1P00966 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASS1P00966 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASS1P00966 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASS1P00966 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASS1P00966 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASS1P00966 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASS1P00966 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASS1P00966 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ASS1P00966 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASS1P00966 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASS1P00966 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASS1P00966 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASS1P00966 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASS1P00966 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASS1P00966 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASS1P00966 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASS1P00966 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASS1P00966 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASS1P00966 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASS1P00966 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASS1P00966 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASS1P00966 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASS1P00966 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASS1P00966 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASS1P00966 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASS1P00966 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASS1P00966 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASS1P00966 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASS1P00966 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASS1P00966 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms