Protein–RNA interactions for Protein: O75177

SS18L1, Calcium-responsive transactivator, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L1O75177 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SS18L1O75177 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SS18L1O75177 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SS18L1O75177 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SS18L1O75177 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SS18L1O75177 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SS18L1O75177 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SS18L1O75177 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SS18L1O75177 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SS18L1O75177 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SS18L1O75177 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms