Protein–RNA interactions for Protein: O60826

CCDC22, Coiled-coil domain-containing protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC22O60826 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC22O60826 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC22O60826 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC22O60826 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC22O60826 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC22O60826 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC22O60826 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC22O60826 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC22O60826 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC22O60826 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC22O60826 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC22O60826 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC22O60826 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC22O60826 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC22O60826 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC22O60826 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC22O60826 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC22O60826 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC22O60826 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC22O60826 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC22O60826 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC22O60826 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC22O60826 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC22O60826 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC22O60826 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC22O60826 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC22O60826 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC22O60826 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC22O60826 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC22O60826 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC22O60826 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC22O60826 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC22O60826 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC22O60826 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC22O60826 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC22O60826 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC22O60826 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC22O60826 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms