Protein–RNA interactions for Protein: O15551

CLDN3, Claudin-3, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3O15551 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN3O15551 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLDN3O15551 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN3O15551 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN3O15551 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN3O15551 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN3O15551 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN3O15551 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN3O15551 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN3O15551 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN3O15551 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN3O15551 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN3O15551 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN3O15551 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN3O15551 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN3O15551 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN3O15551 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN3O15551 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN3O15551 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN3O15551 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN3O15551 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN3O15551 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN3O15551 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN3O15551 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN3O15551 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN3O15551 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms