Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PATL2C9JE40 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PATL2C9JE40 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms