Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF879B4DU55 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF879B4DU55 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms