Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PSDA5PKW4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSDA5PKW4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSDA5PKW4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms