Protein–RNA interactions for Protein: A1L1A6

IGSF23, Immunoglobulin superfamily member 23, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF23A1L1A6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
IGSF23A1L1A6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms