Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CTNND2Q9UQB3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNND2Q9UQB3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms