Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX12Q9UMY4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX12Q9UMY4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms