Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ7

SCP2D1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2D1Q9UJQ7 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCP2D1Q9UJQ7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SCP2D1Q9UJQ7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SCP2D1Q9UJQ7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SCP2D1Q9UJQ7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCP2D1Q9UJQ7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCP2D1Q9UJQ7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCP2D1Q9UJQ7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCP2D1Q9UJQ7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCP2D1Q9UJQ7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCP2D1Q9UJQ7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCP2D1Q9UJQ7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCP2D1Q9UJQ7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCP2D1Q9UJQ7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCP2D1Q9UJQ7 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCP2D1Q9UJQ7 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCP2D1Q9UJQ7 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCP2D1Q9UJQ7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SCP2D1Q9UJQ7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCP2D1Q9UJQ7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCP2D1Q9UJQ7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCP2D1Q9UJQ7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCP2D1Q9UJQ7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCP2D1Q9UJQ7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCP2D1Q9UJQ7 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCP2D1Q9UJQ7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCP2D1Q9UJQ7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCP2D1Q9UJQ7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCP2D1Q9UJQ7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SCP2D1Q9UJQ7 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCP2D1Q9UJQ7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCP2D1Q9UJQ7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCP2D1Q9UJQ7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCP2D1Q9UJQ7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCP2D1Q9UJQ7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCP2D1Q9UJQ7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCP2D1Q9UJQ7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCP2D1Q9UJQ7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCP2D1Q9UJQ7 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCP2D1Q9UJQ7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCP2D1Q9UJQ7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCP2D1Q9UJQ7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCP2D1Q9UJQ7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCP2D1Q9UJQ7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCP2D1Q9UJQ7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCP2D1Q9UJQ7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCP2D1Q9UJQ7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCP2D1Q9UJQ7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCP2D1Q9UJQ7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms