Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CTNNAL1Q9UBT7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CTNNAL1Q9UBT7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CTNNAL1Q9UBT7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNAL1Q9UBT7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNAL1Q9UBT7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNAL1Q9UBT7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNAL1Q9UBT7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNAL1Q9UBT7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNAL1Q9UBT7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNAL1Q9UBT7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNAL1Q9UBT7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNAL1Q9UBT7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNAL1Q9UBT7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNAL1Q9UBT7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNAL1Q9UBT7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CTNNAL1Q9UBT7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTNNAL1Q9UBT7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CTNNAL1Q9UBT7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CTNNAL1Q9UBT7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTNNAL1Q9UBT7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTNNAL1Q9UBT7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTNNAL1Q9UBT7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTNNAL1Q9UBT7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTNNAL1Q9UBT7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTNNAL1Q9UBT7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTNNAL1Q9UBT7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTNNAL1Q9UBT7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CTNNAL1Q9UBT7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CTNNAL1Q9UBT7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms