Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RDH8Q9NYR8 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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RDH8Q9NYR8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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RDH8Q9NYR8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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RDH8Q9NYR8 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
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RDH8Q9NYR8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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RDH8Q9NYR8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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RDH8Q9NYR8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RDH8Q9NYR8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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