Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWH9

SLTM, SAFB-like transcription modulator, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,034 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLTMQ9NWH9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.77e-7■■□□□ 14.3
SLTMQ9NWH9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.341e-6■■□□□ 14.3
SLTMQ9NWH9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.731e-6■■□□□ 14.3
SLTMQ9NWH9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.573e-6■■□□□ 14.3
SLTMQ9NWH9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.071e-6■■□□□ 14.3
SLTMQ9NWH9 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.531e-12■■□□□ 14.3
SLTMQ9NWH9 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.491e-12■■□□□ 14.3
SLTMQ9NWH9 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.051e-12■■□□□ 14.3
SLTMQ9NWH9 SSBP3-207ENST00000426150 851 ntTSL 37.58□□□□□ -1.22e-6■■□□□ 14.3
SLTMQ9NWH9 GNL3L-201ENST00000336470 2357 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.522e-8■■□□□ 14.3
SLTMQ9NWH9 UBE2D2-208ENST00000511725 656 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.684e-6■■□□□ 14.3
SLTMQ9NWH9 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.312e-6■■□□□ 14.3
SLTMQ9NWH9 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.252e-6■■□□□ 14.3
SLTMQ9NWH9 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.142e-6■■□□□ 14.3
SLTMQ9NWH9 FADS1-208ENST00000473263 574 ntTSL 421.72■■□□□ 1.076e-9■■□□□ 14.3
SLTMQ9NWH9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.766e-9■■□□□ 14.3
SLTMQ9NWH9 FADS1-218ENST00000544696 567 ntTSL 319.56■□□□□ 0.726e-9■■□□□ 14.3
SLTMQ9NWH9 FADS1-207ENST00000466716 640 ntTSL 515.89■□□□□ 0.136e-9■■□□□ 14.3
SLTMQ9NWH9 FADS1-214ENST00000540767 742 ntTSL 313.29□□□□□ -0.286e-9■■□□□ 14.3
SLTMQ9NWH9 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.352e-6■■□□□ 14.3
SLTMQ9NWH9 ATP11A-206ENST00000419631 2446 ntTSL 313.92□□□□□ -0.182e-6■■□□□ 14.3
SLTMQ9NWH9 ATP11A-203ENST00000415301 550 ntTSL 413.5□□□□□ -0.252e-6■■□□□ 14.3
SLTMQ9NWH9 CCND1-201ENST00000227507 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.442e-6■■□□□ 14.3
SLTMQ9NWH9 ZC3H18-212ENST00000569435 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 517.46■□□□□ 0.397e-7■■□□□ 14.2
SLTMQ9NWH9 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.087e-7■■□□□ 14.2
SLTMQ9NWH9 ZC3H18-202ENST00000452588 3211 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.237e-7■■□□□ 14.2
SLTMQ9NWH9 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.333e-6■■□□□ 14.2
SLTMQ9NWH9 AL669831.3-208ENST00000634337 891 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.511e-42■■□□□ 14.2
SLTMQ9NWH9 AL669831.3-207ENST00000635509 941 ntTSL 59.31□□□□□ -0.921e-42■■□□□ 14.2
SLTMQ9NWH9 AL669831.3-209ENST00000440200 413 ntTSL 55.97□□□□□ -1.451e-42■■□□□ 14.2
SLTMQ9NWH9 AL669831.3-203ENST00000419394 491 ntTSL 55.82□□□□□ -1.481e-42■■□□□ 14.2
SLTMQ9NWH9 C1orf159-212ENST00000467751 2099 ntTSL 219.82■□□□□ 0.767e-7■■□□□ 14.2
SLTMQ9NWH9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.677e-7■■□□□ 14.2
SLTMQ9NWH9 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.647e-7■■□□□ 14.2
SLTMQ9NWH9 C1orf159-213ENST00000472741 661 ntTSL 418.51■□□□□ 0.557e-7■■□□□ 14.2
SLTMQ9NWH9 C1orf159-218ENST00000482816 982 ntTSL 518.33■□□□□ 0.527e-7■■□□□ 14.2
SLTMQ9NWH9 C1orf159-207ENST00000434641 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 517.87■□□□□ 0.457e-7■■□□□ 14.2
SLTMQ9NWH9 C1orf159-203ENST00000379325 2010 ntTSL 217.56■□□□□ 0.47e-7■■□□□ 14.2
SLTMQ9NWH9 C1orf159-217ENST00000480643 579 ntTSL 415.99■□□□□ 0.157e-7■■□□□ 14.2
SLTMQ9NWH9 C1orf159-209ENST00000462097 836 ntAPPRIS ALT2 TSL 315.33■□□□□ 0.047e-7■■□□□ 14.2
SLTMQ9NWH9 C1orf159-215ENST00000475119 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 315.33■□□□□ 0.047e-7■■□□□ 14.2
SLTMQ9NWH9 C1orf159-216ENST00000477196 3214 ntTSL 214.56□□□□□ -0.087e-7■■□□□ 14.2
SLTMQ9NWH9 TSSC2-206ENST00000533775 1210 ntTSL 520.01■□□□□ 0.792e-7■■□□□ 14.2
SLTMQ9NWH9 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.342e-7■■□□□ 14.2
SLTMQ9NWH9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.281e-9■■□□□ 14.2
SLTMQ9NWH9 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.521e-9■■□□□ 14.2
SLTMQ9NWH9 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.754e-13■■□□□ 14.2
SLTMQ9NWH9 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.74e-13■■□□□ 14.2
SLTMQ9NWH9 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.594e-13■■□□□ 14.2
SLTMQ9NWH9 INS-IGF2-201ENST00000356578 1706 ntTSL 518.21■□□□□ 0.514e-13■■□□□ 14.2
SLTMQ9NWH9 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.024e-13■■□□□ 14.2
SLTMQ9NWH9 INS-IGF2-205ENST00000641326 2861 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.354e-13■■□□□ 14.2
SLTMQ9NWH9 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.83e-9■■□□□ 14.2
SLTMQ9NWH9 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.322e-6■■□□□ 14.2
SLTMQ9NWH9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.131e-7■■□□□ 14.2
SLTMQ9NWH9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.471e-7■■□□□ 14.2
SLTMQ9NWH9 ERF-206ENST00000596818 566 ntTSL 316.5■□□□□ 0.231e-7■■□□□ 14.2
SLTMQ9NWH9 SLC22A18-209ENST00000485423 635 ntTSL 220.52■□□□□ 0.887e-6■■□□□ 14.2
SLTMQ9NWH9 GLI4-206ENST00000520021 361 ntTSL 311.99□□□□□ -0.491e-7■■□□□ 14.2
SLTMQ9NWH9 TCF25-224ENST00000570116 1947 ntTSL 517.17■□□□□ 0.342e-8■■□□□ 14.2
SLTMQ9NWH9 TCF25-206ENST00000562193 627 ntTSL 311.41□□□□□ -0.582e-8■■□□□ 14.2
SLTMQ9NWH9 SLC17A9-203ENST00000411611 565 ntTSL 214.65□□□□□ -0.062e-7■■□□□ 14.1
SLTMQ9NWH9 AC012066.1-201ENST00000439252 694 ntBASIC12.67□□□□□ -0.383e-9■■□□□ 14.1
SLTMQ9NWH9 FAM178B-205ENST00000494172 592 ntTSL 318.69■□□□□ 0.588e-8■■□□□ 14.1
SLTMQ9NWH9 FAM178B-201ENST00000393526 1004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.268e-8■■□□□ 14.1
SLTMQ9NWH9 FAM178B-202ENST00000470789 722 ntTSL 1 (best)11.78□□□□□ -0.528e-8■■□□□ 14.1
SLTMQ9NWH9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.432e-6■■□□□ 14.1
SLTMQ9NWH9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.252e-8■■□□□ 14.1
SLTMQ9NWH9 SLC19A1-204ENST00000427839 648 ntTSL 318.37■□□□□ 0.532e-6■■□□□ 14.1
SLTMQ9NWH9 SLC19A1-205ENST00000443742 777 ntTSL 316.26■□□□□ 0.192e-6■■□□□ 14.1
SLTMQ9NWH9 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.022e-6■■□□□ 14.1
SLTMQ9NWH9 BCAR1-222ENST00000569340 714 ntTSL 313.78□□□□□ -0.24e-8■■□□□ 14.1
SLTMQ9NWH9 MACF1-230ENST00000530275 5767 nt14.97□□□□□ -0.013e-6■■□□□ 14.1
SLTMQ9NWH9 MACF1-234ENST00000641012 4284 ntBASIC11.32□□□□□ -0.63e-6■■□□□ 14.1
SLTMQ9NWH9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.992e-6■■□□□ 14.1
SLTMQ9NWH9 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.62e-6■■□□□ 14.1
SLTMQ9NWH9 OGFR-202ENST00000370461 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.162e-6■■□□□ 14.1
SLTMQ9NWH9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.193e-6■■□□□ 14.1
SLTMQ9NWH9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.713e-6■■□□□ 14.1
SLTMQ9NWH9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.313e-6■■□□□ 14.1
SLTMQ9NWH9 PCSK6-208ENST00000559417 1035 ntTSL 518.83■□□□□ 0.63e-6■■□□□ 14.1
SLTMQ9NWH9 BCAR1-214ENST00000563700 576 ntTSL 415.1■□□□□ 0.015e-7■■□□□ 14.1
SLTMQ9NWH9 GABPB1-212ENST00000615671 6266 nt21.43■■□□□ 1.027e-7■■□□□ 14.1
SLTMQ9NWH9 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.147e-7■■□□□ 14.1
SLTMQ9NWH9 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.087e-7■■□□□ 14.1
SLTMQ9NWH9 GABPB1-203ENST00000380877 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.347e-7■■□□□ 14.1
SLTMQ9NWH9 GABPB1-208ENST00000558970 730 ntTSL 512.9□□□□□ -0.347e-7■■□□□ 14.1
SLTMQ9NWH9 GABPB1-206ENST00000543881 1450 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.457e-7■■□□□ 14.1
SLTMQ9NWH9 GABPB1-210ENST00000560825 1412 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.567e-7■■□□□ 14.1
SLTMQ9NWH9 GABPB1-205ENST00000429662 1392 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.97e-7■■□□□ 14.1
SLTMQ9NWH9 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.547e-7■■□□□ 14.1
SLTMQ9NWH9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.793e-6■■□□□ 14.1
SLTMQ9NWH9 RRBP1-209ENST00000495501 832 ntTSL 520.97■□□□□ 0.954e-8■■□□□ 14.1
SLTMQ9NWH9 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.034e-8■■□□□ 14.1
SLTMQ9NWH9 DNMT3A-204ENST00000380756 4477 ntTSL 1 (best)13.97□□□□□ -0.173e-6■■□□□ 14.1
SLTMQ9NWH9 DNMT3A-202ENST00000321117 4279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.213e-6■■□□□ 14.1
SLTMQ9NWH9 DNMT3A-201ENST00000264709 9501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.33e-6■■□□□ 14.1
SLTMQ9NWH9 RRBP1-210ENST00000610403 3309 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.424e-8■■□□□ 14.1
SLTMQ9NWH9 NCOR2-215ENST00000458234 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)15.21■□□□□ 0.033e-6■■□□□ 14.1
SLTMQ9NWH9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.691e-6■■□□□ 14.1
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