Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LTBP3Q9NS15 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
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