Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ASCL3Q9NQ33 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms